生物化學(xué)化學(xué)重點(diǎn)知識總結(jié)
物理化學(xué)重點(diǎn)知識總結(jié)
第一節(jié)課
1:還原糖的測定(使用斐林試劑或本立德)
斐林試劑成分:硫酸銅、氫氧化鉀、酒石酸鉀鈉(或檸檬酸鈉)糖類在堿性溶液中的還原作用常被利用來作為還原糖的定性和定量分析。成分的作用:
酒石酸鉀鈉的作用:防止反應(yīng)產(chǎn)生的氫氧化銅或碳酸銅沉淀,使之變?yōu)榭扇苄缘亩新阅芙怆x的復(fù)合物,從而保證繼續(xù)供給Cu2+氧化糖。堿的作用:為使糖起烯醇化變?yōu)閺?qiáng)還原劑,同時使硫酸銅變?yōu)镃u(OH)2.
2:葡萄糖Haworth式的書寫!重點(diǎn)!
3:單糖一定是還原糖!
擴(kuò)展閱讀:生物化學(xué)知識點(diǎn)總結(jié)
生物化學(xué)
靜態(tài)生物化學(xué)一、單糖
①定義:醛酮糖
②成環(huán):六元比五元環(huán)穩(wěn);C1-C4五元環(huán)C1-C5六元環(huán);環(huán)鏈平衡③αβ異頭物:三點(diǎn)(α、β、不是對映體)④旋光性,還原性,變旋性:條件
⑤哈沃斯投影式,DL/RS型:O在上,C1,編號順序,左上右下
⑥化學(xué)性質(zhì):與醛酮聯(lián)系,反應(yīng)、作用(氧化、還原、HCN、苯肼成月殺、成苷、強(qiáng)濃酸脫水、弱堿異構(gòu)、強(qiáng)堿弱酸酯化、甲基化成醚、乙;、高碘酸反應(yīng))【反應(yīng)、應(yīng)用】⑦淀粉、唐元與碘反應(yīng):螺旋與顏色;一個還原端;非還原糖(蔗糖、果糖)
二、脂質(zhì)
①定義,分類:單酯、多酯、結(jié)合酯、單三酰甘油酯②油脂:L,Sn,三酰甘油酯(單純甘油酯、混合甘油酯)③甘油:L,Sn
④脂肪酸:C3-C33,多C12-C24的C2n,C>12高級、C③二級結(jié)構(gòu):α-螺旋(3.6、0.15、0.54、1-4,13),β-折疊(鏈間氫鍵),β-轉(zhuǎn)角(1-4氫鍵、拐角Gly)【主鏈構(gòu)象及側(cè)鏈排布】④超二級結(jié)構(gòu):結(jié)構(gòu)域、模體、無規(guī)卷曲
⑤三級結(jié)構(gòu):極性在外成水膜,生物活性與三級結(jié)構(gòu)關(guān)系,亞基⑥四級結(jié)構(gòu):n聚體、分子伴侶
⑦各級作用力:一級肽鍵;二級氫鍵;三級次級鍵(主要為疏水作用力);四級疏
水作用力
⑧性質(zhì):粘度小,含老色本的吸光,有手性、正負(fù)協(xié)同效應(yīng)⑨膠體性質(zhì):1-100nm,三性質(zhì)(丁達(dá)爾、布朗、電),穩(wěn)定因素(2點(diǎn))⑩PI:帶電0→電導(dǎo)率低、溶解度低
⑾沉淀法:有機(jī)物脫水膜;加酸堿到PI(不溶于水,溶于酸堿→變性不一定沉淀);鹽析(沉淀不一定變性)【破壞水膜、同電相斥作用】⑿變性:粘度增,高級結(jié)構(gòu)破壞
⒀變性因素及原因:△(破壞高級作用力),尿素(二級氫鍵),三氯乙酸(成不溶鹽),含硫乙醇(破壞-S-S-)
⒁變性后性質(zhì)變化及原因:溶解度下降(高級紊亂、水膜破壞),顏色變(三級破環(huán)內(nèi)外基團(tuán)換位),變性后才可被酶水解(蛋白酶只破壞肽鍵);黏度增大(面粉)⒂復(fù)性:變性逆過程
⒃化學(xué)性質(zhì):雙縮尿反應(yīng)(與肽鍵反應(yīng),多肽、蛋白質(zhì)反應(yīng),成藍(lán)紫色)茚三酮反應(yīng)(與-NH2)
專一切斷(CNBr:專一切Met羧基端肽鍵;胰蛋白酶:專一切賴精羧基形成的
肽鍵)
N端分析(Sanger)C端分析(羧肽酶解靠近羧基端氨基酸放出多)
++⒄調(diào)節(jié):異構(gòu)化(-S-S-與-SH還原性),修飾,波爾效應(yīng)(HbH+O2HbO2+H,酸性不利于結(jié)合O2)【一個血紅蛋白與四個O結(jié)合】
五、酶
①本質(zhì):Pro.&RNA(P酶,R酶)
②P酶命名:傳統(tǒng)(胃蛋白酶);EC[(ECabcd),a(123456)六類:(氧轉(zhuǎn)水裂異合)]R酶命名:EC[a:1-分子間催化,2-分子內(nèi)催化](加后綴-ase)③全酶:酶蛋白+輔因子(酶蛋白--底物專一性,輔因子---反應(yīng)類型專一性;一個Pro.對應(yīng)一個輔因子,一個輔因子對應(yīng)多個Pro.)【全酶才有活性】④輔因子:輔基輔酶(共價鍵穩(wěn)輔基;疏水作用不穩(wěn)輔酶),化學(xué)本質(zhì)(金屬離子R+、有機(jī)小分子V),作用機(jī)制(R+升降價參與氧化還原反應(yīng);R+靜電作用力參與定向效應(yīng))⑤活化中心:必需基團(tuán);結(jié)合部位;催化部位;調(diào)控部位;酶元無活性原因(活化中心未形
成或暴露)
⑥專一性:絕對鎖鑰學(xué)說;相對(鍵、族)--表面誘導(dǎo)契合學(xué)說;幾何
⑦高效性(催化機(jī)理):過渡態(tài)機(jī)制(核心);鄰近效應(yīng);定向效應(yīng);親核共價;OH⑧酶與底物主要作用力是靜電作用力:(低介電常數(shù)介質(zhì)中靜電屏蔽少,酶活性強(qiáng);靜電作
用力>氫鍵>疏水作用力)
⑨多底物催化機(jī)理:依次反應(yīng)(易反應(yīng)的優(yōu)先);隨機(jī)釋放產(chǎn)物;乒乓反應(yīng)(反應(yīng)前部分產(chǎn)
物釋放)
⑩調(diào)節(jié)性:T、PH、[S]、激活劑,抑制劑(定義);別構(gòu)(變構(gòu)酶不合米氏方程),共價修飾,同工酶【功能同(催化同一反應(yīng)),理化性質(zhì)不同】
-⑾動力學(xué):米氏方程【V=Vmax[S]/(Km+[S]);應(yīng)用(Km與[S]關(guān)系)】;Km=(k2+k3)/k1的意義【Km越小,酶與底物結(jié)合能力越強(qiáng)】、求法(雙倒數(shù)法);Km和Vmax是物理常量⑿抑制劑動力學(xué):可逆不可逆可除不可除,原因(是否共價鍵與活化中心結(jié)合)三可逆抑制劑Km、Vmax變化(競爭抑制劑-與活化中心結(jié)合;-非競爭性抑制劑-與非活性中心結(jié)合)
⒀活力測定:單位(IU、Kat),比活力(酶活力/Pro(RNA)mg數(shù)),轉(zhuǎn)換數(shù)(kp),催化周期
(T=1/kp);初速率V=反應(yīng)5%內(nèi)的速率
⒁RNA酶(核酶):定義、分類【剪切-1(錘頭/發(fā)夾/丁肝病毒核酶),剪接-2】⒂失活作用,抑制作用,去激活作用的區(qū)別⒃幾種抑制劑()
⒄抑制度表示法:相對活力分?jǐn)?shù)(未失活/總);抑制分?jǐn)?shù)(失活/總)⒅競爭抑制:[S]↑→抑制↓
⒆非競爭抑制:[S]與抑制強(qiáng)弱無關(guān)
⒇競爭性抑制非競爭性抑制
六、核酸
①含元素:CHONP,ω=ωP×10.5
②分布分類:DNA(核、線粒體、葉綠體),RNA(質(zhì)中)③組成:核苷=戊糖+堿基;核苷酸=核苷+磷酸④戊糖:β-D型(原因),(脫氧)核糖;⑤堿基:共軛平面(260nm吸紫外線),嘌呤嘧啶⑥核苷:N苷鍵(CN:嘌呤N9C1’;嘧啶N1C1’,假尿嘧啶為CC);【脫氧:d,
環(huán):c】;堿基與糖平面垂直
⑦核苷酸:3’5’(脫氧核糖)/2’3’5’(核糖)可被磷酸酯化,一般為5’酯化;命名(dNMP、NDP、NTP);核苷酸衍生物(αβγ磷酸)
2,222
⑧稀有堿基:-CH3:m,-S:s,-OH:o/h;m2G:N,N-二甲基鳥苷⑨各組分化學(xué)性質(zhì):核糖苔黑酚【綠色】;磷酸鉬酸銨(定磷試劑)【藍(lán)色】;脫氧核糖苯二胺【藍(lán)色】;嘌呤AgNO3+NH3H2O【白色沉淀】⑩一級結(jié)構(gòu):3’,5’-磷酸二酯鍵;5’磷酸,3’OH;5‘→3‘(兩種表示法)
⑾二級結(jié)構(gòu):B-DNA(大小溝、直徑、徑高、反向雙螺旋平行;堿基比率、配對規(guī)則、排列
n種數(shù)(4)、0.34nm的計(jì)算)
※三類DNA(A、B、Z):結(jié)構(gòu)、形成、特點(diǎn)及Z-DNA的作用
RNA(發(fā)夾,5-6對堿基對才穩(wěn))
⑿二級作用力:A=T、C三G氫鍵,堿基堆積力(疏水力,主要)⒀RNA分類與特點(diǎn):mRNA(壽命最短,有密碼子環(huán));tRNA(稀有堿基最多);rRNA(含量多);干擾RNA(干擾基因復(fù)制轉(zhuǎn)錄);SnRNA(不均一RNA,mRNA的前體);hnRNA(核RNA);ScRNA(運(yùn)表達(dá)出的蛋白質(zhì))
⒁mRNA的結(jié)構(gòu):3’PolyA尾結(jié)構(gòu),5’甲基鳥苷帽結(jié)構(gòu);
tRNA的結(jié)構(gòu):二級三葉草形四環(huán)四臂五個區(qū),3’-CCA,三級倒L形⒂超二級結(jié)構(gòu)(質(zhì)粒超螺旋):正負(fù)超螺旋定義、轉(zhuǎn)化、意義、計(jì)算、主要以負(fù)超螺旋存在⒃理化性質(zhì):溶解性(不溶于水,鈉鹽1mol/L,0.14mol/L,DNA比RNA明顯);兩性(P,堿基,PI);260nm吸紫外線;黏度大,酸性;高濃度緩沖液中保存(離子濃度大則Tm高);DNA比RNA明顯
水解【酸(PH雙鏈DNA);全變性(DNA堿性全變性、90C以上全變性增色37%)
⒅Tm:定義(增色18.5%);與C三G、NaCl濃度關(guān)系
3-※DNA穩(wěn)定因素(PO4)與Tm、Z-DNA不穩(wěn)⒆復(fù)性:條件、機(jī)制(Cot曲線)、三個吸光度⒇修飾:甲基化(ACG)動態(tài)生物化學(xué)
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